曾山回到江西,，向中共江西省委擴(kuò)大會(huì)議傳達(dá)了中共六屆六中全會(huì)精神,，指出在敵占區(qū)和國統(tǒng)區(qū)的地下工作,，應(yīng)堅(jiān)決貫徹中共中央作出的“隱蔽精干,，長期埋伏，積蓄力量,，等待時(shí)機(jī)”的工作方針,。1939年春，曾山專程去廣西桂林,，向正在那里的周恩來請(qǐng)示和匯報(bào)工作,。事后，曾山隨周恩來到江西,，經(jīng)浙江金華,、紹興等地，到皖南新四軍軍部及中央東南局視察工作,，周恩來敦促項(xiàng)英貫徹中央向敵后發(fā)展的指示,，確定新四軍的戰(zhàn)略方針是：“向南鞏固，向東進(jìn)攻,，向北發(fā)展,。”同年3月,，曾山回到皖南涇縣丁家山中共中央東南分局,，任副書記兼組織部長,，具體分管民運(yùn)部和敵占區(qū)、國統(tǒng)區(qū)地下黨的工作,。皖南事變后,，曾山任中共中央華中局組織部長。1942年,，抗日戰(zhàn)爭(zhēng)進(jìn)入艱苦斗爭(zhēng)時(shí)期,，當(dāng)時(shí)陳毅痔瘡嚴(yán)重發(fā)作，不能行走,，曾山親自和干部一起抬擔(dān)架送陳毅到彭城醫(yī)院治療,，陳毅感動(dòng)不已。

1942年,，中共中央華中局和新四軍軍部由蘇北鹽城遷往淮南黃花塘,，曾山又兼管華中局的財(cái)經(jīng)工作。他為了保證抗日根據(jù)地內(nèi)軍民的物資供應(yīng),，在根據(jù)地組織干部和群眾大力發(fā)展生產(chǎn),，克服物資上的困難，并通過地下黨組織,，從上海敵占區(qū)秘密購買了大批軍火,、藥品、生活用品等急需物資運(yùn)進(jìn)根據(jù)地,，保證了新四軍及人民群眾的急需,。

為了統(tǒng)一華中根據(jù)地的貨幣免受敵占區(qū)、日統(tǒng)區(qū)通貨膨脹的影響,，設(shè)立了華中印鈔廠,，創(chuàng)建了華中根據(jù)地第一個(gè)銀行——華中銀行。在反掃蕩斗爭(zhēng)中,，曾山親自領(lǐng)導(dǎo)銀行工作人員做好了印鈔廠的安全轉(zhuǎn)移工作,，受到了上級(jí)的表揚(yáng)。

1943年初,，華中局派曾山到新四軍七師指導(dǎo)工作,。曾山剛到蕪湖七師師部時(shí)，就遭到日偽軍的包圍襲擊,，形勢(shì)十分危急,。曾山在遭到日寇機(jī)槍瘋狂掃射危急情況下，他機(jī)敏地從馬背上滾下山溝,，才避免了傷害,。1943—1944年，華中局通過黨校舉辦了幾期縣團(tuán)級(jí)干部整風(fēng)學(xué)習(xí)班。曾山在負(fù)責(zé)每項(xiàng)的審干工作中,，認(rèn)真貫徹了毛澤東“懲前毖后,、治病救人”的方針，沒有出現(xiàn)什么偏差,，保護(hù)了一大批領(lǐng)導(dǎo)干部,。1945年4月23日至6月11日，黨的“七大”在延安召開,，曾山因工作忙未能出席大會(huì),，而被選為中共第七屆中央委員會(huì)委員。這充分說明了黨中央,、毛澤東主席對(duì)他的了解和信任,。

抗日戰(zhàn)爭(zhēng)勝利后，為了人民解放軍由戰(zhàn)略防御轉(zhuǎn)入戰(zhàn)略進(jìn)攻的物資供應(yīng),，曾山大力發(fā)動(dòng)群眾,，通過各種物資流通渠道，出色地做好了華東野戰(zhàn)軍及兄弟部隊(duì)的支前工作,，從而保證了每一次戰(zhàn)斗的勝利,。

1948年下半年，人民解放軍進(jìn)入了戰(zhàn)略決戰(zhàn)階段,。在著名的淮海戰(zhàn)役中,，曾山擔(dān)任華中野戰(zhàn)軍和中原野戰(zhàn)軍的支前工作，夜以繼日在淮海戰(zhàn)場(chǎng)上奔忙,。據(jù)王靜,、趙永希在1979年7月15日《人民日?qǐng)?bào)》發(fā)表的《無產(chǎn)階級(jí)的忠誠戰(zhàn)士——曾山》一文中指出的：“自1947年國民黨軍隊(duì)向山東解放區(qū)發(fā)動(dòng)所謂重點(diǎn)進(jìn)攻，到華東全境獲得解放,，在將近三年多的時(shí)間里,，他（指曾山——作者注）負(fù)責(zé)指揮華東各省,，特別是山東省的廣大農(nóng)民,，每年貢獻(xiàn)出20億斤公糧和其他大量物質(zhì)?！痹谌狈ΜF(xiàn)代運(yùn)動(dòng)工具的情況下,，這些軍糧和軍用物質(zhì)全靠數(shù)十萬數(shù)百萬的人民群眾，主要是農(nóng)民群眾,，用肩挑,、手推車和牲口馱運(yùn)等方法運(yùn)送前線。這其中的動(dòng)員,、組織和運(yùn)輸工作是極其繁重,、艱苦的。曾山為此付出了巨大的精力，做出了重大貢獻(xiàn),。1948年4月,，華東野戰(zhàn)軍解放了山東維坊以后，派曾山任接管委員會(huì)主任,。同年9月華東野戰(zhàn)軍解放山東濟(jì)南后,，又派曾山任濟(jì)南軍管會(huì)主任。他帶領(lǐng)一批財(cái)經(jīng)干部,，出色地完成了接管任務(wù),，并總結(jié)了接管工作的經(jīng)驗(yàn)，受到黨中央的好評(píng),。11月21日,，中共中央在批轉(zhuǎn)曾山寫的《關(guān)于接管濟(jì)南的經(jīng)驗(yàn)報(bào)告》時(shí)指出：“關(guān)于接管濟(jì)南的報(bào)告甚好，轉(zhuǎn)發(fā)各局參考”,、“中央正在根據(jù)你和各地報(bào)告,，利用準(zhǔn)備進(jìn)入平、津的布置,，起草與此有關(guān)的黨內(nèi)指示和軍管期間的各項(xiàng)政策,，以求解決這些問題?！?949年4月,，曾山根據(jù)中央指示，積極為中國人民解放軍百萬雄師強(qiáng)渡長江天塹進(jìn)行物資準(zhǔn)備工作,。他搜集大量木材,，修造過江船只，又從大連和淮海戰(zhàn)場(chǎng)運(yùn)來數(shù)百部繳獲過來的汽車引擎,，用以組裝機(jī)帆船,，對(duì)保證渡江戰(zhàn)役的勝利起了很大作用。1949年4月20日子夜,，人民解放軍發(fā)起了渡江戰(zhàn)役,，23日，一舉解放了南京,。曾山又參加了接管南京市的工作,。同年5月27日，中國最大的沿海城市——上海市解放,，曾山任上海市副市長,，負(fù)責(zé)上海市財(cái)經(jīng)戰(zhàn)線方面的工作。在黨中央領(lǐng)導(dǎo)下和陳毅直接指揮下,，曾山將早在蘇北,、淮南等儲(chǔ)存的大批糧食、棉花、煤炭等物資及時(shí)運(yùn)到上海,，不僅解決了上?！皟砂滓缓凇保ù竺住⒚藁ê兔禾浚┑墓?yīng),，而且有力地打破了過去上海完全依靠進(jìn)口外國物質(zhì)才能生存的局面,。同時(shí)，曾山采取果斷措施,，打擊投機(jī)倒把,，取締上海證券交易所，整理稅收,，統(tǒng)一財(cái)經(jīng),，積極推行公債，讓人民幣占領(lǐng)市場(chǎng),，很快穩(wěn)定了物價(jià),，解決了上海廣大市民飽受多年的通貨膨脹之苦，受到了上海市民的高度稱贊,。