1951年5 月23日,，西藏和平解放協(xié)議和中國(guó)人民解放軍進(jìn)駐西藏若干規(guī)定在北京簽訂,。圖為毛澤東宴請(qǐng)西藏地方全權(quán)代表阿沛·阿旺晉美（左一）、班禪額爾德尼· 卻吉堅(jiān)贊（右三）作陪,。

1952年2月,，中國(guó)人民解放軍西藏軍區(qū)成立時(shí)，中央軍委任命阿沛·阿旺晉美為西藏軍區(qū)第一副司令員,。他時(shí)刻關(guān)心駐藏部隊(duì)的生產(chǎn)和生活,，與部隊(duì)保持緊密聯(lián)系，在鞏固國(guó)防,、保衛(wèi)邊疆的工作中,，作出了應(yīng)有貢獻(xiàn)。

與此同時(shí),，阿沛·阿旺晉美以維護(hù)和貫徹執(zhí)行《十七條協(xié)議》為己任,，自覺(jué)地通過(guò)各種方式在貴族官員和各階層人士中宣傳協(xié)議，發(fā)展壯大愛(ài)國(guó)力量,?？墒牵呦蚝推浇夥诺牡缆凡⒎且环L(fēng)順,。1952年初反動(dòng)組織偽“人民會(huì)議”公開(kāi)進(jìn)行非法活動(dòng),，公開(kāi)反對(duì)《十七條協(xié)議》,，提出要解放軍撤出西藏。3月31日,，偽“人民會(huì)議”煽動(dòng)1000多名“藏軍”和流氓,、無(wú)業(yè)游民，武裝包圍了中央代表駐地,，要求遞交“請(qǐng)?jiān)笗?shū)”,。在拉薩街頭，武裝分子游行示威,，呼喊反動(dòng)口號(hào),，鬧得人心惶惶，商店關(guān)門(mén),。有些武裝分子公然開(kāi)槍挑釁,，阿沛家的窗戶玻璃被打碎。面對(duì)危局,，阿沛立場(chǎng)堅(jiān)定,，旗幟鮮明，反對(duì)騷亂,，維護(hù)安定,，全力支持、配合中央代表和軍區(qū)領(lǐng)導(dǎo),，按照中央指示，本著有理,、有利,、有節(jié)的政治原則，力爭(zhēng)用和平方式平息這一事件,。他態(tài)度積極,，方式靈活，發(fā)揮了既是西藏地方政府的噶倫又是西藏軍區(qū)第一副司令員的雙重身份的優(yōu)勢(shì),，夜以繼日地做了大量工作：一方面勸說(shuō)其他噶倫維護(hù)《十七條協(xié)議》,，同偽“人民會(huì)議”劃清界限；另一方面深入了解掌握偽“人民會(huì)議”的活動(dòng)情況,，隨時(shí)向中央代表和軍區(qū)領(lǐng)導(dǎo)反映,，采取應(yīng)對(duì)措施，避免陷于被動(dòng),。經(jīng)過(guò)多方努力,，5月1日，偽“人民會(huì)議”被取締,，他們的非法活動(dòng)以失敗而告終,。

1954年,，阿沛同西藏的其他代表一起，赴北京出席了第一屆全國(guó)人民代表大會(huì)第一次會(huì)議,。這是西藏人民代表第一次行使管理國(guó)家事務(wù)的權(quán)利,。在這次會(huì)議上，阿沛當(dāng)選為國(guó)防委員會(huì)委員,。

1954年11月4日,，西藏自治區(qū)籌備委員會(huì)籌備小組正式成立，阿沛·阿旺晉美成為這個(gè)籌備小組的成員之一,。經(jīng)過(guò)多次協(xié)商討論,，籌備小組于同年年底向國(guó)務(wù)院提交了成立西藏自治區(qū)籌備委員會(huì)具體方案的工作報(bào)告。

1955年3月9日,，周恩來(lái)總理主持召開(kāi)國(guó)務(wù)院全體會(huì)議第七次會(huì)議,，專題研究成立西藏自治區(qū)籌備委員會(huì)及西藏有關(guān)事宜，通過(guò)了《國(guó)務(wù)院關(guān)于成立西藏自治區(qū)籌備委員會(huì)的決定》,。同年9月20日,，西藏自治區(qū)籌備委員會(huì)籌備處在拉薩成立，阿沛·阿旺晉美被推選為處長(zhǎng),。經(jīng)過(guò)籌備處全體人員近4個(gè)月緊張有序的工作,，各方條件均已成熟，中共西藏工委報(bào)請(qǐng)中央同意,，決定西藏自治區(qū)籌備委員會(huì)于1956年4月22日成立,。

為慶祝西藏自治區(qū)籌委會(huì)的成立，中央派出以中共中央委員,、國(guó)務(wù)院副總理陳毅為團(tuán)長(zhǎng)的規(guī)模龐大的代表團(tuán),，萬(wàn)里迢迢，跋山涉水,，到西藏進(jìn)行祝賀和慰問(wèn),，拉薩僧俗人民3萬(wàn)多人熱烈歡迎中央代表團(tuán)。

自治區(qū)籌委會(huì)成立后,，在用和平方式改革舊制度,、改造舊政權(quán)，并且推動(dòng)西藏地方政府和西藏領(lǐng)導(dǎo)人自動(dòng)地去進(jìn)行這些改革和改造中,，阿沛·阿旺晉美進(jìn)行了勇敢的嘗試,。他在籌委會(huì)籌備處的工作中處理了大量人事工作，安排舊政權(quán)的大批官員在籌委會(huì)和直屬機(jī)構(gòu)及下屬機(jī)構(gòu)中擔(dān)任各種職務(wù),，通過(guò)對(duì)舊官員的改造達(dá)到對(duì)舊政權(quán)的改造,。他還擔(dān)任學(xué)習(xí)委員會(huì)主任，領(lǐng)導(dǎo)在籌委會(huì)系統(tǒng)工作的舊官員學(xué)習(xí)政治理論和時(shí)事政策,，參加籌委會(huì)派出的各種工作組,，接近群眾,，體驗(yàn)生活，轉(zhuǎn)變作風(fēng),。經(jīng)過(guò)兩年多的努力,，許多舊官員的思想和作風(fēng)有了明顯變化，中央堅(jiān)持和平改造的政策初見(jiàn)成效,，這使阿沛感到由衷的欣慰,。