郭汝瑰在解放后的歷次政治運動中,，曾經(jīng)與許多黨的干部一樣，受到不同程度的沖擊,。在肅反運動中,，因為一個教員胡亂編造假坦白交代的材料，致使郭汝瑰也被關(guān)押審查,。郭汝瑰怎么也沒有想到自己放棄國民黨的高官厚祿,，毅然投入革命陣營，反遭人誣陷為假起義的真特務(wù),。但他不管如何逼供誘供,，始終不說假話。不久事情真相大白,。當時任軍事學(xué)院政委的鐘期光上將親自向他賠禮道謙,，并且贊揚說:“在軍事學(xué)院的肅反運動中，只有兩個半人沒有說假話,，其中你是表現(xiàn)最好的一個,。”

郭汝瑰對黨忠誠，也就敢于直言,。肅反運動后,，一些準備轉(zhuǎn)業(yè)的教員要求評軍銜，慫恿郭汝瑰起草一份給國防部長彭德懷的信,。郭希望黨組織能接受肅反中輕信一些人作假坦白的教訓(xùn),，在信中寫了幾句尖銳的話:“一些無恥之徒，希圖過關(guān),，假坦白，攀誣好人,。一時滿城風雨,，鬼影憧憧，逼得懸梁的懸梁,，投水的投水,。”這封信因一些同志嫌言詞過激,，決定將分發(fā)征求意見的打印稿全部收回,。但有個覬覦者卻心懷鬼胎，把一份打印稿收藏起來,。等到1957年反右派運動一來，就作為炮彈拋出來，說郭汝瑰惡毒地攻擊肅反運動,。加上在南京市委召開的整風會上,，郭汝瑰說了:“劉邦入關(guān)，約法三章,；李世民尊賢納諫,，從善如流，所以才能將政權(quán)鞏固了幾百年,，我們要厲行民主法制,，才能長治久安?！边@些本來是正確的話,，竟被說成“郭汝瑰攻擊共產(chǎn)黨連古代帝王都不如”。于是,，一些原來是郭汝瑰部下的教員,，都紛紛站出來批判他。軍事學(xué)院曾準備將他劃為右派,，結(jié)果中央軍委批示:“情節(jié)經(jīng)微,，不作右派處理。”郭汝瑰又逃過一劫,。以極左路線發(fā)展至極端的“文化大革命”中,，當時軍事學(xué)院軍事史料研究處的一位領(lǐng)導(dǎo)，為保護自己,，裝出一副極左的面目,，四處張揚說“我們處成分復(fù)雜”，動員一些學(xué)員在“點鬼臺”上點鬼,，把副處長郭汝瑰點成“牛鬼蛇神”,、“反動學(xué)術(shù)權(quán)威”，并讓史料處所屬六個級輪番批斗,。郭汝瑰見過人硬頂挨打,，覺得自挨一頓打不值，批斗時給他加上的罪名他都承認,，于是就斗不下去了,。軍院的造反派闖入郭汝瑰住處抄家，得知他的女兒郭相慰與他們同屬一派,，不但沒有抄家,，還與她握手連稱同志，弄得郭汝瑰啼笑皆非,。由于造反派忙于內(nèi)戰(zhàn),，再無暇顧及郭汝瑰，在挨了一陣批斗之后,，就被安排到軍事學(xué)院所屬的農(nóng)場進行體力勞動,，倒沒有遭受被關(guān)押、毆打等痛苦,。

早在1945年,，郭汝瑰就要求恢復(fù)自己的共產(chǎn)黨黨籍。雖一時未能如愿,，但他從那時起就嚴格按照共產(chǎn)黨員的標準要求自己,。除了奮不顧身地完成黨交給的任務(wù)之外，在污濁的國民黨官場中,，也堅持廉潔自守,。1946年他到南京任職，在四條巷租了一套普通民房居住,。當時蔣經(jīng)國住在三條巷,，與他是近鄰。一天,，蔣經(jīng)國到郭家探望,，發(fā)現(xiàn)郭夫人自己在廚房做飯，端到飯桌上的只有兩樣素菜，不禁喟然嘆息說:“要是我們的高級將領(lǐng),，都像郭汝瑰這樣就好了,。”有些人也因郭汝瑰生活如此儉樸,，懷疑他是潛伏的共產(chǎn)黨人,。

四川解放后，郭汝瑰任川南交通廳長時,，以熱愛勞動,、生活儉樸而被人稱道。但是,，他多次提出恢復(fù)黨籍或重新入黨的要求,，都被上推下卸，長期擱置下來,。直到中共十一屆三中全會以后的1980年4月,，郭汝瑰直接給中共中央組織部寫信,，申述自己的全部歷史,，反映多年的入黨要求，不久他所在的中國人民解放軍重慶警備區(qū)黨委接到了中組部的通知:“準許郭汝瑰入黨”,，郭汝瑰才實現(xiàn)了自己的政治宿愿,。1981年，成都軍區(qū)黨委又根據(jù)郭汝瑰的優(yōu)異表現(xiàn),，將他評為全軍區(qū)的優(yōu)秀共產(chǎn)黨員,。