一度關(guān)系緊張的馬英九和王金平在吳伯雄的調(diào)解下也冰釋前嫌，吳伯雄曾表示,，有人質(zhì)疑他個(gè)性太溫和,，投入佛教后，連吵架都不會(huì)吵,。但是菩薩也有金剛之怒,，如果有人對(duì)國(guó)民黨進(jìn)行“清算斗爭(zhēng)”，他會(huì)強(qiáng)勢(shì)反應(yīng),，并強(qiáng)勢(shì)要求大家團(tuán)結(jié),。

2007年2月,，時(shí)任國(guó)民黨代理主席吳伯雄邀請(qǐng)馬英九及王金平會(huì)面聚餐，王,、馬在吳伯雄要求下喝交杯酒,。吳伯雄則開(kāi)玩笑說(shuō)，喝完交杯酒后,，就準(zhǔn)備進(jìn)“洞房”了,，希望兩人絕對(duì)要合作團(tuán)結(jié)。

吳伯雄一直非常支持馬英九,。