S-400防空導(dǎo)彈系統(tǒng)即采用了S-300系統(tǒng)所用的導(dǎo)彈,，也推出了自己獨有的新型導(dǎo)彈,。

S-400防空導(dǎo)彈系統(tǒng)的新型導(dǎo)彈：9M96E(前)和 9M96E2(中),，這兩種導(dǎo)彈射程分別為40和120公里，雖然較S-300PMU2系統(tǒng)里的48N6E2導(dǎo)彈(后)的200公里射程近一些,，但是體積小速度快,，在同一發(fā)射筒里可儲存4枚,，適宜用于反導(dǎo)攔截,。