北洋海軍“致遠(yuǎn)”艦軍官水兵與外國(guó)顧問(wèn)合影

事后中日雙方通過(guò)外交和司法的途徑進(jìn)行了長(zhǎng)達(dá)幾個(gè)月的談判,，開始日方態(tài)度強(qiáng)硬，中方也不甘示弱,，甚至在中方談判者中有人提出“撤使絕交,、以兵相脅”的主張，談判最后延至1887年2月雙方在英,、德公使的調(diào)停下彼此讓步才算達(dá)成協(xié)議：稱這次沖突是語(yǔ)言不通,，彼此誤會(huì)，沒(méi)有追究責(zé)任和是非,，對(duì)死傷者各給撫恤：軍官,、警官的恤金每人6000元，水兵,、警察恤金每人4500元,。水兵因傷殘廢者每人2500元。由此核算日方共付恤款52500元,，中方共付恤款15500元,，此外長(zhǎng)崎醫(yī)院的醫(yī)療救護(hù)費(fèi)2700元由日方支付,。

在交涉中李鴻章深信此事錯(cuò)在日本：“長(zhǎng)崎之哄，發(fā)端甚微,。初因小爭(zhēng),，而倭遂潛謀報(bào)復(fù)，我兵不備,，致陷機(jī)牙,。觀其未晚閉市,，海岸藏艇,，巡捕帶刀，皆非向日所有,，謂為挾嫌尋釁,，彼復(fù)何辭？”是非曲直顯然,，中國(guó)“斷無(wú)不堅(jiān)持到底之理”,，而“日人自知理短，斷不敢再生事端,，貽人口實(shí)”,，通過(guò)據(jù)理力爭(zhēng)總算為國(guó)人挽回了一點(diǎn)面子。

“長(zhǎng)崎事件”雖然得以和平了結(jié),，但在日本當(dāng)局的挑動(dòng)下其民間的反華,、仇華、排華的情緒卻因此被煽動(dòng)起來(lái),。日本朝野的軍國(guó)主義思想越來(lái)越濃厚,，當(dāng)時(shí)深受刺激的日本海軍由此出現(xiàn)一句流行話：“一定要打勝‘定遠(yuǎn)’?！痹谲妵?guó)主義思想蠱惑之下,，甚至連天真幼稚的小學(xué)兒童也開始玩起了打擊中國(guó)軍艦的游戲：即把孩子分成兩組，一組扮成中國(guó)艦隊(duì),，另一組扮成日本艦隊(duì),，進(jìn)行捕捉“定遠(yuǎn)”、“鎮(zhèn)遠(yuǎn)”的戰(zhàn)斗游戲,。

李鴻章把北洋軍艦送到日本修理本來(lái)就含有威懾的意圖,，卻沒(méi)想到竟如此深深地刺激了日本人的民族心理，日本朝野拼命發(fā)展海軍的狂熱情緒也由此被煽動(dòng)起來(lái),。日方鑒于清朝軍艦“定遠(yuǎn)”號(hào),、“鎮(zhèn)遠(yuǎn)”號(hào)外觀新穎，威力強(qiáng)大,，深感力不從心,，從此之后不斷增加對(duì)海軍的投入,，加強(qiáng)艦隊(duì)建設(shè)，務(wù)期超過(guò)中國(guó),。1887年3月天皇下令從內(nèi)庫(kù)撥款30萬(wàn)元作為海防補(bǔ)助費(fèi),，全國(guó)的貴族和富豪無(wú)不為天皇資助海軍建設(shè)的行為而感動(dòng)也都競(jìng)相為海防捐款，至9月底捐款數(shù)就達(dá)到103.8萬(wàn)元,，這些資金全被用作擴(kuò)充海軍軍備,。1888年和1890年日本又提出第七次和第八次海軍擴(kuò)張案，這兩次擴(kuò)張案共購(gòu)買或建造了“千代田”號(hào)(2439噸),、“吉野”號(hào)(4160噸),、“秋津洲”號(hào)(3172噸)巡洋艦、“八重山”號(hào)(1584噸)通報(bào)艦,。