同年11月,，孔祥熙免兼財政部長,，由俞鴻鈞接任，但是，他的行政院副院長一職則仍然未變,。22日，傅斯年致函蔣介石稱：“昨讀報紙,，知政府局部改組”,，“聞此消息，如聞打一大勝仗,，兩夜為之不眠,，友朋中有為之泣涕者”。但是,，傅斯年也指出：“以目下最低之需要論,，似尚有一著，留而未下,。若下,，則此次改革之效至為彰明；不下,，恐此次改革之分量減少甚多矣,。”傅斯年明確表示：此著,，就是孔祥熙還當著副院長,。函中，他竭力說明,，當時整理財政的急務(wù)是：整理稅收,、懲治貪污,、增加效能、更易首長,、清理大事件,，孔祥熙副院長一職不變，俞鴻鈞有職無權(quán),，將無法工作,。

1944年末，傅斯年致函蔣介石,，于外交,、內(nèi)政多所建議，在內(nèi)政部分,，傅斯年再次提出高級官員經(jīng)營商業(yè),，利用政治力量為自己謀利等嚴重問題，認為其危害遠過于直接性的貪污,。他把這種情況,，稱之為“失官箴”。函件說：

欲矯下層之弊,，仍必先澄上層之源,。上層之弊，未可直言其貪污,，然失官箴之處,，則甚矣! 以影響論，直接性之貪污,，為害固遠不逮間接性之失官箴,。
傅斯年舉例說：孔氏家族開辦的“祥記公司”的招牌已高掛重慶林森路多年。又如中國農(nóng)民銀行掛牌出售黃金,，一般人買不到,，而孔氏家族經(jīng)營的裕華銀行卻得以大量購進，高價售出,，“此一波折,，國家失去不少黃金，裕華得數(shù)萬萬元之凈益”,。傅斯年由此不點名地批評孔祥熙包庇下屬，竭力掩護,。他說：“往事不待論,，今財政部正有若干重大地方機關(guān)舞弊事件，一本其‘大事化小,，小事化無’之原則處理之,?！?

函中，傅斯年要求“裁并一切駢枝機關(guān)”,，特別強烈要求“徹底禁止官吏及其家屬兼營商業(yè)”,。函末，傅斯年提出：人事改革為事業(yè)改革之本,，要求蔣介石抓緊時機,，“以人事之改革一新中外之耳目，而以事務(wù)之徹革隨之”,。

這回,，傅斯年等人的意見起作用了。1945年5月,，蔣介石決定另覓行政院正副院長人選,。 5月31日，國民黨六屆一中全會根據(jù)蔣介石提議,，選舉宋子文,、翁文灝為行政院正副院長。

窮打猛追,，揭發(fā)貪污大案

孔祥熙丟掉行政院副院長一職,，猶如冰山崩塌。1945年7月,，傅斯年出席國民參政會四屆一次大會,，進一步提出國庫局貪污案，導致孔祥熙最后失勢,。

1943年,，財政部將“1942年同盟勝利美金公債”交中央銀行國庫局分發(fā)各地銀行發(fā)行，總額美金1億元,，折合國幣20億元,。1943年10月15日，財政部函知國庫局停售該項債票,，所有未售出的債票約5千萬元,，悉數(shù)由中央銀行業(yè)務(wù)局購進，但國庫局局長呂咸及熊國清等人卻在孔祥熙的支持下,，利用職權(quán),，以低價套購，謀取暴利,。據(jù)估計,，貪污數(shù)達國幣26億4千7百余萬元。1944年春，國庫局的幾個青年人多次向重慶國民政府某機關(guān)密告,，某機關(guān)雖然派人調(diào)查,，卻查而不辦。在此情況下,，他們便向參政員求助,。

在參政會上，傅斯年就此案作了口頭質(zhì)詢,，另一參政員陳賡雅即以準備好的一份提案相示,，其中數(shù)目、證據(jù)具在,，要求大會討論,，送請政府嚴辦。傅斯年遂立即簽名,，領(lǐng)銜提出,。